Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms