Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Homer2Q9QWW1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms