Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms