Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot9Q9JKY0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot9Q9JKY0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms