Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trem1Q9JKE2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms