Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ropn1Q9ESG2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ropn1Q9ESG2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms