Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clstn1Q9EPL2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms