Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eif3fQ9DCH4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Eif3fQ9DCH4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms