Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smco2Q9DA21 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smco2Q9DA21 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms