Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y8

Ssmem1, RIKEN cDNA 1700025E21, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssmem1Q9D9Y8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ssmem1Q9D9Y8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssmem1Q9D9Y8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms