Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn9Q9D805 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn9Q9D805 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn9Q9D805 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn9Q9D805 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn9Q9D805 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn9Q9D805 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn9Q9D805 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn9Q9D805 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn9Q9D805 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn9Q9D805 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms