Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms