Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D4W2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D4W2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms