Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms