Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms