Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RpainQ9CWY9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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