Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Txndc17Q9CQM5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Txndc17Q9CQM5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms