Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRCC1Q9C099 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRCC1Q9C099 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms