Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab27bQ99P58 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab27bQ99P58 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab27bQ99P58 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab27bQ99P58 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab27bQ99P58 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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