Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thumpd1Q99J36 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thumpd1Q99J36 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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