Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tubb6Q922F4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms