Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sf3b3Q921M3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b3Q921M3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms