Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx4Q91YJ2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx4Q91YJ2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms