Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brd3Q8K2F0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Brd3Q8K2F0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms