Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trip10Q8CJ53 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trip10Q8CJ53 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms