Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms