Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Actrt3Q8BXF8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actrt3Q8BXF8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms