Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbbp5Q8BX09 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms