Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan9Q8BJU2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan9Q8BJU2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms