Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ScocQ78YZ6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ScocQ78YZ6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms