Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtprnQ60673 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms