Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa3Q505D7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opa3Q505D7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms