Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srek1ip1Q4V9W2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms