Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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D130052B06RikQ3UW13 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms