Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ulk3Q3U3Q1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ulk3Q3U3Q1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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