Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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