Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim24Q0VG18 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim24Q0VG18 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim24Q0VG18 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim24Q0VG18 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim24Q0VG18 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim24Q0VG18 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim24Q0VG18 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim24Q0VG18 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim24Q0VG18 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms