Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rcn1Q05186 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rcn1Q05186 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms