Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Kcnb1Q03717 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms