Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Q6P79568 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Q6P79568 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms