Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rps28P62858 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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