Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab3cP62823 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3cP62823 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms