Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sem1P60897 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sem1P60897 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sem1P60897 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms