Protein–RNA interactions for Protein: P59108

Cpne2, Copine-2, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne2P59108 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne2P59108 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne2P59108 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne2P59108 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne2P59108 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne2P59108 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne2P59108 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne2P59108 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne2P59108 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne2P59108 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne2P59108 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne2P59108 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpne2P59108 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpne2P59108 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms