Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm2P58774 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm2P58774 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms