Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc1a3P56564 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a3P56564 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms