Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf5P56477 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf5P56477 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf5P56477 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf5P56477 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf5P56477 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf5P56477 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf5P56477 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf5P56477 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irf5P56477 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf5P56477 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf5P56477 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf5P56477 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf5P56477 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf5P56477 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Irf5P56477 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Irf5P56477 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irf5P56477 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irf5P56477 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irf5P56477 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irf5P56477 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms