Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LmnaP48678 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
LmnaP48678 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LmnaP48678 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms