Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syt4P40749 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms