Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VhlP40338 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VhlP40338 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VhlP40338 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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VhlP40338 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VhlP40338 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VhlP40338 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VhlP40338 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VhlP40338 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VhlP40338 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VhlP40338 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VhlP40338 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VhlP40338 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VhlP40338 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VhlP40338 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VhlP40338 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VhlP40338 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VhlP40338 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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VhlP40338 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VhlP40338 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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